Trabalho de Conclusão de Curso - Implementações

Table of Contents

• About
• Getting Started
• Usage

About

Está branch versionará todas as implementações realizadas no desenvolvimento do TCC.

Getting Started

These instructions will get you a copy of the project up and running on your local machine for development and testing purposes. See deployment for notes on how to deploy the project on a live system.

Prerequisites

É necessário ter os seguintes programas instalados:

python3
ncbi-blast+
Clustal Omega
Scipy
virtualenv (Opcional)

Gerando arquivo requirements.txt (Caso necessário atualizar o já existente)

pip freeze > requirements.txt

Installing

É recomendado que a instalação dos pacotes necessários seja realizada em um ambiente virtual.

Passos iniciais para criação do ambiente virtual com o virtualenv e instalação das bibs requeridas pelo projeto: Obs.: A criação do ambiente virtual deve ser realizado dentro da pasta do projeto.

virtualenv `nome_do_ambiente`
source `nome_do_ambiente`/bin/activate
pip install -r requirements.txt

Instalação necessárias feitas em um sistema linux(Caso estaja em outro SO, verifique como realizar a instalação no seu caso):

- sudo apt install ncbi-blast+
- sudo apt install clustalo
- sudo apt install python3-scipy

Após isso é possível abrir e executar os notebooks disponíveis.

Usage

Add notes about how to use the system.